Use com iniciais maiúsculas e vírgula.

A sessão plenária deliberativa tem a pauta trancada pelo projeto de lei de conversão (PLV 15/2012) que amplia crédito do BNDES e altera regras do Minha Casa, Minha Vida.

O Programa Minha Casa, Minha Vida também foi alterado pela Lei 12.688, de 2012.

Observe que a palavra programa também fica em inicial maiúscula quando seguida de nome próprio.